Das Errechnen der Wichtigkeit startet der Nutzer, sobald er überzeugt ist, daß keine weiteren Varianten mit akzeptablen Erfolg zu beobachten sind. Mit dem Anklicken von "Verarbeiten" startet das Programm seine Suche nach der Relevanz jedes Faktors. In der rechten unteren Ecke des Programmfensters ist anhand des Anzeigebalkens der Analysefortschritt abzulesen.
Zunächst prüft das Programm, ob die aktiven Beispiele vollständig beschrieben sind, d.h. zu allen Merkmalen sind Ausprägungen aufgezeichnet. Andernfalls bricht das Programm die Verarbeitung ab. Bei unvollständig beschriebenen Beispielen könnte nicht entschieden werden, ob ein Referenzbeispiel mit dem Kandidaten übereinstimmt. Ebenso muß die Beispielbasis zumindest zwei aktive Faktoren und zwei aktive Beispiele enthalten. Höchstens 15 aktive Faktoren verarbeitet das Programm zugleich. Diese Höchstgrenze wurde gesetzt, weil mit der Zahl der aktiven Faktoren auch die Zahl der erforderlichen Beispiele steigt und derzeit nicht erwartet wird, mit dem FACTORFINDER-Verfahren Analyseprobleme zu bearbeiten, bei denen die Zahl der aktiven Einflußgrößen über 15 liegt. Dem Nutzer ist es jederzeit möglich, die Verarbeitung durch das Anklicken von "Abbruch" zu beenden. Nach Abschluß der Berechnung gibt das Programm die Relevanz für jeden Faktor aus. Sie wird oberhalb jedes Faktorschaltfelds angezeigt (sofern der Anzeigefilter nicht nur verborgene Faktoren einblendet).
Die Relevanz jedes Faktors sinkt, je mehr ähnliche Beispiele der Nutzer aufzeichnet. Das Ergänzen eines weiteren ähnlichen Beispiels senkt die Werte weiter.
Bei einzelnen Alternativen stellt das Programm möglicherweise besonders niedrige Komplementärwerte fest. Das Programm weist damit den Nutzer auf ideale Beispiele hin. Besonders hohe Komplementärwerte zeigen Beispiele an, die von allen anderen Beispielen stark abweichen. Diese Informationen erhält der Nutzer durch das Einblenden eines neuen Ausgabefensters, das durch Anklicken von "Sitzung" und "Baumdiagramm" geöffnet wird.
Die FACTORFINDER-Software zeigt auch, welche Auswirkungen die Eingabe eines stark abweichenden Beispieles auf das Analyseergebnis hat. Das wäre ein Beispiel, das sich weitgehend von den idealen Alternativen unterscheidet und auch in den wichtigen Dimensionen anders ausgeprägt ist als alle anderen akzeptablen Beispiele. Der Relevanzvektor hat sich verändert, die Werte sind gesunken. Dies war zu erwarten, da mit jedem weiteren Erfolgsbeispiel zusätzliche plausible Vergleichspaare entstehen und die Toleranz der Merkmale gegenüber zielhemmenden Ausprägungen größer erscheint. Eine gestiegene Toleranz wiederum ist mit geringerer Relevanz der Analysedimensionen gleichzusetzen.
Trotz gesunkener Relevanz der Faktoren ist die Abweichung einer ungewöhnlichen Alternative im Verhältnis zu den vermutlich idealen Beispielen überkritisch. Dadurch identifiziert die FACTORFINDER-Software die überkritisch abweichenden Alternativen. Dies diskreditiert entweder die Gültigkeit der Erfolgshypothese zu diesen Beispielen oder aber die Relevanzhypothese muß als ungültig angesehen werden.